More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7287 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
892 aa  1743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  77.78 
 
 
863 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  53.33 
 
 
737 aa  303  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  55.07 
 
 
518 aa  285  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  50.16 
 
 
1030 aa  276  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  53.9 
 
 
807 aa  274  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50.67 
 
 
716 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  52.28 
 
 
850 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  50.51 
 
 
772 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  52.68 
 
 
719 aa  258  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  48.9 
 
 
1750 aa  256  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  46.56 
 
 
1351 aa  254  7e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  44.8 
 
 
732 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 
552 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.99 
 
 
682 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  46.46 
 
 
770 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  51.23 
 
 
756 aa  210  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  44.27 
 
 
623 aa  207  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  40.49 
 
 
1763 aa  206  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  54.36 
 
 
295 aa  205  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  38.32 
 
 
646 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  39.05 
 
 
963 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  42.39 
 
 
520 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  36.89 
 
 
439 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  38.14 
 
 
1051 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  40.45 
 
 
951 aa  175  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 
600 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  35.84 
 
 
2831 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 
468 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  38.01 
 
 
1026 aa  172  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  42.44 
 
 
2296 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39 
 
 
645 aa  171  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
651 aa  170  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
776 aa  170  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.5 
 
 
641 aa  169  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  40.6 
 
 
1057 aa  169  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  40 
 
 
1053 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 
596 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 
632 aa  167  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
604 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.32 
 
 
584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.38 
 
 
520 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  40.88 
 
 
531 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
673 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
894 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  35.93 
 
 
381 aa  165  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
666 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.64 
 
 
667 aa  164  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0097  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
675 aa  163  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255203  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  39.18 
 
 
620 aa  163  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  36.01 
 
 
425 aa  163  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 
746 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 
1104 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 
700 aa  162  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.15 
 
 
614 aa  161  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.16 
 
 
1130 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  36.95 
 
 
776 aa  160  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
612 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.5 
 
 
627 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
468 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 
565 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.42 
 
 
682 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37 
 
 
603 aa  159  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  40.23 
 
 
1032 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
641 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.59 
 
 
700 aa  158  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  40.23 
 
 
1032 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  39.88 
 
 
2350 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
583 aa  157  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
563 aa  157  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.56 
 
 
740 aa  157  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 
646 aa  157  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  40.43 
 
 
572 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 
628 aa  157  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  37.27 
 
 
985 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.61 
 
 
620 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
632 aa  156  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.66 
 
 
647 aa  157  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 
862 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  39.77 
 
 
1018 aa  156  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  36.12 
 
 
457 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.6 
 
 
652 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 
773 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.2 
 
 
648 aa  155  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
450 aa  155  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  36.26 
 
 
609 aa  155  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  40.36 
 
 
623 aa  155  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.78 
 
 
907 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  36.46 
 
 
661 aa  154  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  39.71 
 
 
554 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
599 aa  153  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
618 aa  154  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38.83 
 
 
863 aa  154  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 
691 aa  154  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 
360 aa  153  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7672  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.77 
 
 
650 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.93 
 
 
562 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00760  probable pknA serine-threonine protein kinase  40.08 
 
 
704 aa  153  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
614 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  38.46 
 
 
758 aa  152  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>