195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7266 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  86.38 
 
 		 303 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  55.82 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  53 
 
 		 304 aa  285  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  53.85 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  49.66 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  47.67 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  48.12 
 
 		 286 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  46.39 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  46.05 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  47.1 
 
 		 286 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  46.23 
 
 		 291 aa  225  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  46.58 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  46.58 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  43.2 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  44.82 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  45.61 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  42.96 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  42.96 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  42.96 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  40.8 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.92 
 
 		 280 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  40.07 
 
 		 285 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  40 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  40.56 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  43.17 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  38.1 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  46.07 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  38.1 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  38.1 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  41.88 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  41.88 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  43.01 
 
 		 279 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  43.45 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  41.16 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  39.78 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  41.64 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  35.54 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.14 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.21 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  35.13 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  35.21 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.94 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  26.51 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  26.2 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  27.9 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  27.24 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  27 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  27.63 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  26.67 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.5 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  28.67 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  26.33 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  26.33 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  26.33 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.19 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.63 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.07 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.94 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  26.67 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.72 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  29.41 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  28.82 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.74 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.43 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  30.1 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  26.82 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  26.85 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.07 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  28.31 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  26.2 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  25 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  25 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  25 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  30.29 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  25.62 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  30.13 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.57 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  29.76 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  26.27 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.36 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  26.22 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  29.93 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  26.07 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.27 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  26.79 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  26.22 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  29.93 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  26.22 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.3 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  32.56 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  30.56 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.19 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.05 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>