17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7234 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7234  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  858    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.273739  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  50 
 
 		 358 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  35.93 
 
 		 272 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  35.25 
 
 		 335 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  35.25 
 
 		 335 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  35.56 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  35.06 
 
 		 275 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  41.04 
 
 		 287 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  40.09 
 
 		 287 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  33.83 
 
 		 265 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  31.6 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  35.84 
 
 		 297 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.12 
 
 		 1888 aa  63.5  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  26.34 
 
 		 2313 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  28.95 
 
 		 2914 aa  57.4  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  24.31 
 
 		 223 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>