98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7219 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 224 aa  417  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  43.62 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  35.1 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  42.35 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  43.31 
 
 		 190 aa  85.9  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  34.84 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  37.56 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  33.79 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  34.67 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  33.93 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  37.18 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  33.49 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  37.74 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  41.18 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  35.33 
 
 		 194 aa  62  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  42.14 
 
 		 168 aa  62  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  33.63 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  32.92 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  27.91 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  35.71 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  33.12 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32.73 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  32.19 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  35.67 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  31.06 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  31.51 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  34.36 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  25.83 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  32.9 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  30.63 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 177 aa  52.4  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.8 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  29.88 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  31.88 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  35.77 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  35.92 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.13 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  29.81 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  35.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  37.74 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  28.4 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  32.17 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  33.75 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  37.84 
 
 		 177 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  36.03 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  33.95 
 
 		 180 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  26 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  29.7 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  32.19 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  26.11 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  26.11 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  37.39 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  25.32 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  26.11 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  30.83 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  23.08 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  26.11 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  31.45 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  26.11 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  32.03 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  40.68 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  27.72 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  33.13 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  33.13 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.53 
 
 		 181 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  37.74 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  27.5 
 
 		 183 aa  45.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  29.36 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.69 
 
 		 181 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.71 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  32.72 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0760  2'-5' RNA ligase  38 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  32.93 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  23.9 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  25.6 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  25.88 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  30.82 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  22.93 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  30.82 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  27.7 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  25.68 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 186 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  31.37 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  36.63 
 
 		 182 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  34.23 
 
 		 172 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  29.7 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  29.7 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  32.38 
 
 		 178 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>