More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7101 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 496 aa  982    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.82 
 
 		 405 aa  363  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.61 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  38.24 
 
 		 442 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  45.32 
 
 		 393 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  35 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.75 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.87 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  38.61 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  37.67 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.07 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  35.01 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  41.54 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.07 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.29 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.5 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  38.61 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  39.72 
 
 		 387 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.37 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  40.46 
 
 		 380 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.63 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  34.37 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  39.19 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.81 
 
 		 400 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  35.88 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  37.79 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  33.13 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.03 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.99 
 
 		 442 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 394 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  37.24 
 
 		 428 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 441 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.76 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  34.23 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  36.84 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  35.44 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 406 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  40.7 
 
 		 419 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  33.53 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  31.95 
 
 		 397 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  36.96 
 
 		 428 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  34.17 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  36.89 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  32.55 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  30.09 
 
 		 422 aa  134  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  31.8 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 423 aa  133  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.58 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  32.97 
 
 		 378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.84 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  34.52 
 
 		 423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  32 
 
 		 402 aa  130  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  33.67 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.46 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.12 
 
 		 400 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 420 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.65 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  33.52 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  31.91 
 
 		 445 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.7 
 
 		 446 aa  126  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  32.96 
 
 		 462 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  33.55 
 
 		 369 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  39.37 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  39.57 
 
 		 457 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  35.94 
 
 		 408 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 424 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.11 
 
 		 443 aa  124  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.59 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 500 aa  123  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  33.53 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  37.65 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  40.4 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.6 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.82 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  35.66 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  36.7 
 
 		 357 aa  120  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  33.96 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.74 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  35.83 
 
 		 407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  34.96 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  37.55 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 438 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>