More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7085 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1265 aa  2476    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  60.65 
 
 		 1401 aa  1229    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  44.95 
 
 		 1657 aa  873    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 1334 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  35.83 
 
 		 1344 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 		 1711 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1553 aa  396  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.43 
 
 		 1481 aa  389  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1510 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.44 
 
 		 1760 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.14 
 
 		 1686 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1230 aa  370  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  31.72 
 
 		 1733 aa  366  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.47 
 
 		 1357 aa  335  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.02 
 
 		 1240 aa  321  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  33.18 
 
 		 901 aa  318  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.24 
 
 		 1236 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  29.39 
 
 		 1699 aa  307  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.92 
 
 		 1598 aa  275  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.58 
 
 		 1583 aa  266  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.34 
 
 		 1355 aa  261  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.2 
 
 		 1684 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.83 
 
 		 1623 aa  254  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.48 
 
 		 1609 aa  250  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.45 
 
 		 1547 aa  246  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.49 
 
 		 1823 aa  240  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.5 
 
 		 1599 aa  236  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.69 
 
 		 919 aa  233  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1491 aa  230  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.22 
 
 		 1163 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  36.83 
 
 		 1152 aa  227  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 		 947 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.45 
 
 		 1652 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1157 aa  218  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.29 
 
 		 1363 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1196 aa  214  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.91 
 
 		 1656 aa  211  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.94 
 
 		 1256 aa  211  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.75 
 
 		 1523 aa  207  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.19 
 
 		 1217 aa  206  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.05 
 
 		 1398 aa  204  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  29.86 
 
 		 902 aa  204  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  32.47 
 
 		 1308 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.99 
 
 		 1626 aa  201  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.54 
 
 		 1188 aa  201  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  35.39 
 
 		 885 aa  198  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 1221 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1073 aa  192  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1399 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1211 aa  184  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.92 
 
 		 1557 aa  184  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 972 aa  184  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.56 
 
 		 1364 aa  182  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1117 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.35 
 
 		 865 aa  181  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.09 
 
 		 833 aa  181  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.07 
 
 		 924 aa  181  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1229 aa  181  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.75 
 
 		 1190 aa  180  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.01 
 
 		 1161 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.73 
 
 		 1161 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1367 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.36 
 
 		 1190 aa  170  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.36 
 
 		 1901 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.14 
 
 		 1193 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 973 aa  169  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.68 
 
 		 696 aa  167  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.01 
 
 		 1247 aa  167  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1176 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 		 1078 aa  167  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 		 1164 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.54 
 
 		 1443 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.42 
 
 		 1213 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 969 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 969 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.97 
 
 		 1831 aa  157  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.78 
 
 		 737 aa  157  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 1013 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.89 
 
 		 1262 aa  156  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 		 897 aa  156  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1552 aa  155  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1474 aa  155  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 		 965 aa  155  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.09 
 
 		 1454 aa  154  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.63 
 
 		 828 aa  153  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  33.86 
 
 		 1194 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1026 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.18 
 
 		 930 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 		 1209 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  26.78 
 
 		 1032 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1661 aa  144  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.58 
 
 		 729 aa  144  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 		 1353 aa  143  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.2 
 
 		 1177 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  26.76 
 
 		 994 aa  140  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.1 
 
 		 1348 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.11 
 
 		 1607 aa  138  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.95 
 
 		 1766 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.32 
 
 		 1858 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>