281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7074 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  59.38 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  55.45 
 
 		 325 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  58.67 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  52.65 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  45.6 
 
 		 313 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  46.47 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  52.08 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  46.25 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  46.06 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  47.32 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  44.79 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  43.45 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  44.94 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  46.08 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  46.08 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  46.08 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  42.81 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  46.06 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  43.29 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  42.81 
 
 		 344 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  40.23 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  35.28 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  41.41 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  38.59 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  34.45 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  39.02 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  34.67 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  34.33 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.32 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  32.26 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  31.65 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.16 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  38.11 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  36.79 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.54 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  36.93 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  39.43 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  33.57 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.86 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  41.57 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.42 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  40.91 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  34.11 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  32.26 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.26 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.9 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.9 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  30.11 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.9 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  36.77 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  31.9 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  33.45 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.54 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  39.81 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  41.95 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  39.16 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.44 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  31.1 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.16 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.16 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  37.97 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  37.84 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  37.84 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  37.84 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  30.25 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  31.18 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  36.58 
 
 		 326 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  34.46 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  34.46 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  32.66 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  32.56 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  35.23 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  38.74 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  37.58 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  36.5 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  37.42 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  32.06 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  34.88 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  37.93 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  40.3 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  31.91 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  38.22 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  32.3 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  34 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  34.11 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  31.74 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.04 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  39.37 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>