171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7036 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  100 
 
 		 251 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  48.31 
 
 		 317 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  45.69 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  45.81 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  45.98 
 
 		 316 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  45.85 
 
 		 317 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  45.85 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  45.85 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  45.89 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  45.63 
 
 		 309 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  42.92 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  42.79 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  41.05 
 
 		 334 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  39 
 
 		 321 aa  131  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  42.72 
 
 		 309 aa  131  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  42.15 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  38.89 
 
 		 329 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  41.06 
 
 		 317 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  40.57 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  41.01 
 
 		 332 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  41.2 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  41.28 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  37.86 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  41.28 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  39.21 
 
 		 333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  36 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  40.57 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  43.06 
 
 		 300 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  38.65 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  36.28 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 		 311 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  33.96 
 
 		 306 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  33.48 
 
 		 313 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  36.06 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  36.06 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  36.73 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  33.18 
 
 		 306 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  35.65 
 
 		 338 aa  85.9  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  32.16 
 
 		 312 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  33.02 
 
 		 309 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  32.88 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  34.13 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  32.58 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  35.75 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  31.36 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  33.17 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  32.87 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  34.7 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  30.14 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  31.67 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  25.63 
 
 		 319 aa  78.6  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  29.19 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  33.49 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  29.95 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  29.22 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.28 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  30.73 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  31.13 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  29.24 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  29.73 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  31.3 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  31.25 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  33.05 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  31.14 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  28.45 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  30.56 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.75 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  33.16 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.75 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.8 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  32.83 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27.84 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.46 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  24.89 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.8 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  28.65 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  27.75 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.27 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  31.71 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  30.96 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  28.02 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.91 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.78 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.69 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  30.57 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  28.92 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  31.4 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.18 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  27.46 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  22 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  22.5 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  28.7 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>