More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6795 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 889 aa  1697    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  52.79 
 
 		 923 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  49.89 
 
 		 953 aa  797    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 928 aa  340  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  35.79 
 
 		 884 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  34.22 
 
 		 928 aa  287  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  33.37 
 
 		 925 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  33.88 
 
 		 919 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  33.08 
 
 		 929 aa  249  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  40.84 
 
 		 927 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  42.06 
 
 		 892 aa  214  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 950 aa  213  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  31.78 
 
 		 913 aa  213  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 		 938 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  34.38 
 
 		 913 aa  213  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  41.13 
 
 		 930 aa  198  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  31.49 
 
 		 995 aa  193  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 929 aa  190  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  41.46 
 
 		 940 aa  189  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  40.85 
 
 		 928 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 946 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 918 aa  181  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  43.11 
 
 		 894 aa  177  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  37.53 
 
 		 909 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 919 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  38.35 
 
 		 934 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  41.11 
 
 		 961 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 937 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  39.3 
 
 		 937 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.57 
 
 		 923 aa  161  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  39.04 
 
 		 937 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  38.55 
 
 		 955 aa  160  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 911 aa  157  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  33.84 
 
 		 917 aa  151  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 923 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.7 
 
 		 923 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  38.01 
 
 		 904 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  36.11 
 
 		 884 aa  142  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  35.33 
 
 		 920 aa  140  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  34.46 
 
 		 927 aa  138  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 913 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 1064 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 916 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 940 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.6 
 
 		 879 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 997 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 927 aa  111  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  42.42 
 
 		 240 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 936 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 919 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.94 
 
 		 919 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.94 
 
 		 919 aa  109  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  41.18 
 
 		 977 aa  105  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 921 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  34.71 
 
 		 921 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  35 
 
 		 921 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  37.82 
 
 		 922 aa  103  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.22 
 
 		 910 aa  102  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  52.85 
 
 		 903 aa  97.8  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  50.41 
 
 		 905 aa  94.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 915 aa  93.2  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  37.28 
 
 		 916 aa  92.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  36.31 
 
 		 893 aa  91.7  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  46.61 
 
 		 894 aa  91.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 189 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 910 aa  88.6  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 881 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 881 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 876 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  36.6 
 
 		 921 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 1000 aa  85.1  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 		 918 aa  84.7  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  45.38 
 
 		 929 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 877 aa  82.4  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  51.69 
 
 		 974 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 946 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 932 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 947 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 998 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 960 aa  75.1  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  28.26 
 
 		 897 aa  73.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  32.34 
 
 		 959 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  47.52 
 
 		 943 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  37.4 
 
 		 970 aa  73.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  46.6 
 
 		 963 aa  71.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 959 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 1321 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.16 
 
 		 981 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 		 895 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.52 
 
 		 1403 aa  68.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 		 900 aa  68.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 940 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 1137 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 882 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 910 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 948 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.46 
 
 		 947 aa  64.7  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  59.26 
 
 		 827 aa  64.3  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  47.67 
 
 		 952 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>