More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6773 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
518 aa  1041    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  59.39 
 
 
737 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  61.15 
 
 
716 aa  315  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  57.29 
 
 
863 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  55.07 
 
 
892 aa  296  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  59.17 
 
 
772 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  55.19 
 
 
807 aa  266  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 
719 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  57.63 
 
 
295 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.9 
 
 
682 aa  249  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  56.58 
 
 
756 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  47.44 
 
 
770 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  44.57 
 
 
552 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  49.22 
 
 
732 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 
850 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.55 
 
 
627 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  34.83 
 
 
692 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  41.67 
 
 
1057 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  40.96 
 
 
1032 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.85 
 
 
664 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  40.96 
 
 
1032 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 
691 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
585 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38.65 
 
 
612 aa  164  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0097  serine/threonine protein kinase  43.24 
 
 
675 aa  163  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255203  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  41.67 
 
 
1018 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.02 
 
 
668 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  36.01 
 
 
457 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
666 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
612 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.25 
 
 
632 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.84 
 
 
598 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  39.93 
 
 
1053 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.55 
 
 
776 aa  160  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  37.92 
 
 
403 aa  160  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.09 
 
 
641 aa  159  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  36.02 
 
 
646 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
520 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
624 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
624 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
624 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  40.71 
 
 
468 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.64 
 
 
499 aa  157  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.93 
 
 
635 aa  157  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 
673 aa  156  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1104  serine/threonine protein kinase  39.85 
 
 
607 aa  156  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.511251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.33 
 
 
676 aa  156  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.04 
 
 
681 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  36.45 
 
 
625 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
703 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
450 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.2 
 
 
579 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  38.01 
 
 
609 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.64 
 
 
603 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 
618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  36.64 
 
 
625 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 
614 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 
600 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 
582 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  39.06 
 
 
758 aa  154  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.96 
 
 
747 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.05 
 
 
406 aa  153  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  36.54 
 
 
625 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  34.36 
 
 
621 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1729  serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 
301 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.372145  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.97 
 
 
682 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 
543 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  37.82 
 
 
519 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  34.34 
 
 
869 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  38.2 
 
 
951 aa  152  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 
690 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  35.37 
 
 
620 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  36.53 
 
 
746 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  35.14 
 
 
667 aa  151  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37 
 
 
843 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 
645 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  40.47 
 
 
668 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.45 
 
 
700 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.72 
 
 
602 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  33.26 
 
 
593 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  38.4 
 
 
626 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.41 
 
 
584 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  37.97 
 
 
618 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.11 
 
 
715 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  37.96 
 
 
1479 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 
615 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.88 
 
 
681 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
439 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.4 
 
 
657 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  41.18 
 
 
572 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 
468 aa  150  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
568 aa  150  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
700 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
480 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.04 
 
 
551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  37 
 
 
691 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  38.01 
 
 
661 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>