More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6721 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  100 
 
 		 494 aa  1009    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  75.21 
 
 		 656 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  43.59 
 
 		 492 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  38.62 
 
 		 487 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  45 
 
 		 377 aa  281  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  33.71 
 
 		 508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  33.71 
 
 		 508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.02 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.3 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.48 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28 
 
 		 390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  29.23 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  29.01 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31.53 
 
 		 379 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.32 
 
 		 389 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.14 
 
 		 477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.78 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  30 
 
 		 378 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.03 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.19 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.44 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.55 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 368 aa  127  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.95 
 
 		 370 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.84 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.78 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.3 
 
 		 400 aa  124  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.7 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.01 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.78 
 
 		 369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.28 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.78 
 
 		 369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.7 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.13 
 
 		 370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  28.21 
 
 		 383 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.46 
 
 		 305 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.88 
 
 		 385 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  28.4 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.53 
 
 		 379 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 379 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.67 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.17 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.22 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3454  integrase family protein  33.33 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.21 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.89 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.77 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.35 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  25 
 
 		 471 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4338  phage integrase  76.4 
 
 		 207 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.857538  normal  0.897623 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.29 
 
 		 392 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.64 
 
 		 383 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.82 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  26.69 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  24.87 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.53 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.54 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.53 
 
 		 443 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  24.6 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  26.89 
 
 		 506 aa  97.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.47 
 
 		 397 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.44 
 
 		 365 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 465 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  23.94 
 
 		 413 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  21.66 
 
 		 378 aa  90.1  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  35.2 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.15 
 
 		 357 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.55 
 
 		 398 aa  87  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.46 
 
 		 384 aa  86.7  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  31.55 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  23.1 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  22.32 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  26.26 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.94 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  35.04 
 
 		 121 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0388  hypothetical protein  48.51 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 209 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25.3 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  23.95 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  31.43 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  34.53 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  34.53 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  22.73 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  23.51 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  22.22 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  21.99 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  29.9 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  25.11 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  20.98 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>