276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6589 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
333 aa  631  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  73.66 
 
 
293 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  48.92 
 
 
255 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  45.28 
 
 
243 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  40.35 
 
 
284 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  43.28 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  39.46 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  44 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3726  ApbE family lipoprotein  36.24 
 
 
273 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  46.67 
 
 
347 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.39 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  26.13 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  33.75 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  36.2 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  27.8 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  39.43 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  39.13 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  36 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.17 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  29.2 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  33.14 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  35.33 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  35.33 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  37.24 
 
 
239 aa  72.4  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.67 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.06 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  28.78 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  34.67 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  24.59 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  27.85 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  38.24 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.5 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  38.06 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  40 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  26.23 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  35.46 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  34.93 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  34.56 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  38.46 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.82 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  33.57 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  31.19 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  36.53 
 
 
386 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.23 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  33.1 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  28.25 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.2 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.57 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.47 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  27.74 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.81 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  31.88 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  27.89 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  35.98 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  36.49 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  34.96 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.12 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  34.31 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  21.51 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.9 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  35.91 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  37.23 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  29.31 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  28.06 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  35.39 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  40.15 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  30.25 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.07 
 
 
370 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  37.14 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  32.68 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  24.7 
 
 
344 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  43.8 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  32.74 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  29.65 
 
 
352 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  40.15 
 
 
327 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 
344 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  34.34 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  37.98 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  37.5 
 
 
331 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.33 
 
 
351 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  33.9 
 
 
365 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  29.03 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  35.37 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  31.36 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.33 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  23.15 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  37.11 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.33 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>