186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6572 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  86.6 
 
 
194 aa  345  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  67.86 
 
 
191 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  67.35 
 
 
191 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  67.35 
 
 
191 aa  263  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  65.82 
 
 
191 aa  262  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  65.82 
 
 
222 aa  262  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  65.82 
 
 
191 aa  259  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  63.27 
 
 
191 aa  252  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  62.24 
 
 
192 aa  248  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  61.73 
 
 
191 aa  244  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  59.18 
 
 
192 aa  230  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  59.69 
 
 
192 aa  227  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  58.67 
 
 
191 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  58.67 
 
 
192 aa  224  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  58.16 
 
 
191 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  58.67 
 
 
191 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  57.14 
 
 
191 aa  221  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  57.14 
 
 
191 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  58.16 
 
 
191 aa  220  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  55.9 
 
 
192 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  55.9 
 
 
192 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  55.9 
 
 
192 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  57.22 
 
 
191 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  56.7 
 
 
191 aa  218  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  53.57 
 
 
192 aa  218  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  56.12 
 
 
191 aa  217  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  55.1 
 
 
192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  54.08 
 
 
192 aa  214  7e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  59.49 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  56.12 
 
 
192 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  58.97 
 
 
193 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  54.59 
 
 
192 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  53.85 
 
 
192 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  53.33 
 
 
192 aa  207  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  55.61 
 
 
192 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  53.33 
 
 
191 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  55.1 
 
 
191 aa  205  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  55.1 
 
 
191 aa  205  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  53.57 
 
 
191 aa  205  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  52.04 
 
 
248 aa  204  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  54.08 
 
 
191 aa  201  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  50.77 
 
 
191 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  52.31 
 
 
191 aa  200  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  52.04 
 
 
192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  51.02 
 
 
191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  53.06 
 
 
191 aa  198  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  52.06 
 
 
190 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  51.79 
 
 
191 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  53.09 
 
 
191 aa  191  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  52.06 
 
 
192 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  46.43 
 
 
192 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  46.28 
 
 
189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  45.92 
 
 
192 aa  178  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  46.43 
 
 
192 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  45.92 
 
 
192 aa  177  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  45.41 
 
 
192 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  46.94 
 
 
218 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  48.4 
 
 
190 aa  176  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  45.41 
 
 
192 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  45.41 
 
 
192 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  45.41 
 
 
192 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  48.11 
 
 
192 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  47.57 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  44.39 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  46.94 
 
 
194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  46.94 
 
 
194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  46.94 
 
 
194 aa  171  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  46.43 
 
 
196 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  46.43 
 
 
196 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  46.43 
 
 
196 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  46.43 
 
 
194 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  46.43 
 
 
194 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  44.81 
 
 
191 aa  170  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  46.43 
 
 
194 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  46.43 
 
 
194 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  46.49 
 
 
192 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  46.49 
 
 
192 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  45.36 
 
 
192 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1169  stress protein  45.36 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1939  stress protein  45.86 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  44.39 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  41.33 
 
 
186 aa  157  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0385  tellurium resistance protein  44.04 
 
 
198 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  44.04 
 
 
198 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0399  tellurium resistance protein  44.04 
 
 
198 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0464  putative tellurium resistance protein  44.04 
 
 
198 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  44.04 
 
 
198 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0373  TerD family tellurium resistance protein  44.56 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0443  putative tellurium resistance protein  44.04 
 
 
198 aa  154  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  43.43 
 
 
194 aa  154  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  43.43 
 
 
194 aa  154  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0513  putative tellurium resistance protein  43.52 
 
 
198 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0111767  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  42.36 
 
 
199 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  43.52 
 
 
198 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1164  stress protein  43.24 
 
 
191 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  41.06 
 
 
200 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  42.36 
 
 
199 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0379  stress protein  43.52 
 
 
198 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  43.01 
 
 
198 aa  151  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>