More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6566 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  92.96 
 
 
199 aa  380  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  80.3 
 
 
199 aa  330  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  78.89 
 
 
199 aa  328  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  80.4 
 
 
199 aa  326  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  79.7 
 
 
199 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  77.95 
 
 
199 aa  324  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  77.95 
 
 
199 aa  319  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  78.97 
 
 
199 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  76.92 
 
 
199 aa  316  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  77.16 
 
 
202 aa  315  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  75.9 
 
 
199 aa  313  8e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  75.76 
 
 
199 aa  313  9e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  76.41 
 
 
199 aa  310  9e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  75.9 
 
 
199 aa  307  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  72.31 
 
 
199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  73.6 
 
 
197 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  74.62 
 
 
199 aa  304  6e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  73.37 
 
 
199 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  73.1 
 
 
197 aa  301  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  70.26 
 
 
199 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  72.59 
 
 
197 aa  295  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  71.21 
 
 
204 aa  295  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  68.18 
 
 
199 aa  292  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  72.22 
 
 
199 aa  291  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  70.41 
 
 
198 aa  289  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  71 
 
 
202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  68.88 
 
 
197 aa  275  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  64.04 
 
 
203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  65.02 
 
 
203 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  65.02 
 
 
203 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  65.02 
 
 
203 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  64.53 
 
 
203 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1288  recombination protein RecR  64.04 
 
 
203 aa  263  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404677  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  64.58 
 
 
203 aa  259  2e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4008  recombination protein RecR  63 
 
 
215 aa  254  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  59.18 
 
 
202 aa  248  4e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  60.82 
 
 
200 aa  244  6e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0437  recombination protein RecR  64.53 
 
 
203 aa  244  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  59.38 
 
 
198 aa  243  9e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  58.85 
 
 
198 aa  240  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  59.47 
 
 
198 aa  236  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  52.06 
 
 
199 aa  231  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  54.12 
 
 
198 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  55.15 
 
 
199 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  51.79 
 
 
199 aa  228  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  53.61 
 
 
198 aa  226  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  56.84 
 
 
204 aa  225  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  54.69 
 
 
204 aa  223  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  51.55 
 
 
199 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  53.61 
 
 
199 aa  222  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  54.69 
 
 
204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  54.17 
 
 
204 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  53.66 
 
 
215 aa  218  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  51.03 
 
 
198 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3201  recombination protein RecR  56.84 
 
 
205 aa  217  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000136854  normal  0.489368 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  51.3 
 
 
201 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  51.31 
 
 
205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  51.03 
 
 
199 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  51.02 
 
 
198 aa  214  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  51.02 
 
 
198 aa  214  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  50 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  56.84 
 
 
222 aa  214  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  50.77 
 
 
197 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  50.26 
 
 
198 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  49.74 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  50.26 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  49.74 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  50.51 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  50.51 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  50.51 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  50.51 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  50.51 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  50.51 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  50.51 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  50 
 
 
198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  49.74 
 
 
200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  50.52 
 
 
198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  51.3 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  56.7 
 
 
199 aa  211  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  49.23 
 
 
199 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  54.01 
 
 
198 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  54.01 
 
 
198 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  53.76 
 
 
197 aa  209  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000418809  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  51.08 
 
 
198 aa  209  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5291  recombination protein RecR  53.4 
 
 
212 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  54.01 
 
 
198 aa  207  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  54.55 
 
 
198 aa  205  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  52.04 
 
 
198 aa  205  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  50.8 
 
 
189 aa  205  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  49.73 
 
 
199 aa  204  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  46.19 
 
 
198 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  46.19 
 
 
198 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  51.34 
 
 
192 aa  202  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  47.37 
 
 
194 aa  202  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  47.67 
 
 
203 aa  202  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  51.32 
 
 
195 aa  202  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  50.52 
 
 
199 aa  201  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  49.73 
 
 
185 aa  200  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0096  recombination protein RecR  52.15 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>