More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6543 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
329 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  71.97 
 
 
313 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  64.53 
 
 
340 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
334 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
714 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  46.41 
 
 
317 aa  258  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  33.69 
 
 
652 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 
324 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
324 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  41.95 
 
 
324 aa  168  9e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  38.77 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.53 
 
 
311 aa  162  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
705 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  38.56 
 
 
334 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
298 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
310 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.48 
 
 
355 aa  155  8e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 
304 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
324 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
311 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
307 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
289 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
299 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
387 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
294 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  36.74 
 
 
361 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
308 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
303 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.33 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
310 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
317 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
318 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  34.05 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
318 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 
305 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
308 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  36.86 
 
 
307 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  33.69 
 
 
314 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
360 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
319 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
293 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  31.91 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
691 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
358 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  30.91 
 
 
274 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
337 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
691 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
691 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
312 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
315 aa  119  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
315 aa  119  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 
288 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
296 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
296 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
296 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
303 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
822 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
683 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
1152 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
322 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
310 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 
336 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  33.62 
 
 
2401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  33.21 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
1739 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
300 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 
1340 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  33.61 
 
 
284 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
326 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
305 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>