More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6515 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
227 aa  454  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  61.88 
 
 
242 aa  258  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  59.45 
 
 
233 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  38.64 
 
 
374 aa  138  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  36.02 
 
 
200 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40 
 
 
198 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.71 
 
 
200 aa  122  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.13 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  39.88 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  40.13 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  36.09 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  38 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.61 
 
 
243 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.36 
 
 
197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.9 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.73 
 
 
501 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.29 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  36.71 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  31.89 
 
 
198 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  42.38 
 
 
231 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.76 
 
 
230 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.86 
 
 
237 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.36 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  40.4 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  40.4 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.31 
 
 
221 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  36.69 
 
 
259 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  38.31 
 
 
220 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.5 
 
 
204 aa  105  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  37.66 
 
 
220 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  33.96 
 
 
231 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  37.42 
 
 
220 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.13 
 
 
221 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  39.87 
 
 
270 aa  102  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.1 
 
 
204 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  37.01 
 
 
220 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  33.14 
 
 
234 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
229 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.26 
 
 
199 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  37.41 
 
 
221 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  37.42 
 
 
229 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.96 
 
 
230 aa  101  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.58 
 
 
196 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  33.57 
 
 
218 aa  101  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  33.74 
 
 
234 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.3 
 
 
465 aa  101  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  38.06 
 
 
202 aa  101  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  30.32 
 
 
197 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  32.54 
 
 
234 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  30.32 
 
 
197 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.99 
 
 
200 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
189 aa  99.4  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  32.54 
 
 
554 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  38.73 
 
 
523 aa  99  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  36.14 
 
 
220 aa  99  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  37.89 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.14 
 
 
262 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.14 
 
 
262 aa  95.9  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.5 
 
 
505 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.74 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.64 
 
 
341 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.81 
 
 
505 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.2 
 
 
202 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.63 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.56 
 
 
509 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.71 
 
 
412 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  31.28 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  33.13 
 
 
262 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.81 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.43 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0133  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.67 
 
 
300 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158116  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.26 
 
 
512 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  35.03 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  34.21 
 
 
570 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  36.18 
 
 
608 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.73 
 
 
334 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  32.95 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.27 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  31.95 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.99 
 
 
345 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.77 
 
 
400 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  33.53 
 
 
402 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.77 
 
 
403 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.64 
 
 
301 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 
258 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  37.6 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  28.32 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  31.95 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  31.03 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  38.51 
 
 
247 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  38.51 
 
 
247 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  33.15 
 
 
414 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  31.58 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.56 
 
 
515 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  28.63 
 
 
260 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  31.18 
 
 
534 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  39.26 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  31.03 
 
 
255 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.16 
 
 
531 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>