More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6463 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  100 
 
 		 283 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  44.13 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  44.53 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  46.27 
 
 		 255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.4 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  35.89 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  35.62 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  36.1 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  35.74 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.74 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.52 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.51 
 
 		 285 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  34.3 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.02 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  33.45 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  40.89 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  33.45 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  33.45 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  33.45 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  33.45 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  33.45 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  32.86 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  34.28 
 
 		 305 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  37.09 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  32.11 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  38.12 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.69 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.41 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.3 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.93 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  26 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.86 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.86 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.57 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.8 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.99 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 581 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.86 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  39.39 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  41 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  37.86 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.89 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.86 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.86 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.29 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  38.79 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.25 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>