14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6307 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  75.37 
 
 
476 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  91.96 
 
 
572 aa  954    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  84.71 
 
 
572 aa  906    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  85.41 
 
 
569 aa  907    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  93.37 
 
 
573 aa  993    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  100 
 
 
572 aa  1147    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  59.13 
 
 
543 aa  591  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  59.4 
 
 
552 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  52.94 
 
 
568 aa  555  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  52.13 
 
 
550 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  51.41 
 
 
577 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  52.38 
 
 
527 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  51.24 
 
 
555 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  58.93 
 
 
56 aa  67.8  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>