103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6302 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  100 
 
 		 177 aa  350  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  63.74 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  63.84 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  63.84 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  62.71 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  61.54 
 
 		 179 aa  207  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  60.71 
 
 		 168 aa  203  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  58.18 
 
 		 168 aa  198  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.4 
 
 		 167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  56.55 
 
 		 164 aa  188  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  58.43 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  56.02 
 
 		 167 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  52.27 
 
 		 210 aa  169  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  43.64 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.67 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  41.78 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.88 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.34 
 
 		 164 aa  91.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.25 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.8 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  32.61 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  32.61 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.2 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  33.54 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.3 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.76 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.25 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  29.81 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.93 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.4 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  28.17 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.21 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  28.99 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.88 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.88 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  32 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.41 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  30.71 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.33 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  31.68 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.68 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.98 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30.73 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  27.85 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  27.22 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.97 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.17 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  31.08 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  36.91 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  23.49 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  29.29 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.76 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  26.95 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  33.56 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  28.21 
 
 		 153 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  24.32 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.62 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.84 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  29.17 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.99 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  23.78 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  32.87 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  22.53 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.87 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  33.33 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  31.71 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  33.11 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.99 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.11 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.11 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  27.27 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  31.14 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  28.83 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  34.69 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  28.12 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  28.12 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  32.17 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  26.51 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.78 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.6 
 
 		 163 aa  44.3  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  30.15 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  25.47 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  29.58 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  24.39 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  26.44 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.9 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  25.56 
 
 		 174 aa  42  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  30.08 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  25.73 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  33.04 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  26.24 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  30.08 
 
 		 162 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.76 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>