More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6284 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 381 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  60.09 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  54.73 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  55.81 
 
 		 361 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  51.86 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  52.91 
 
 		 298 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  47.5 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  45.99 
 
 		 408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  33.69 
 
 		 493 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  37.23 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  40.51 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  51.05 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  33.47 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  41.09 
 
 		 449 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  46.58 
 
 		 286 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  40.38 
 
 		 225 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.27 
 
 		 567 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  44.1 
 
 		 386 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.02 
 
 		 309 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  44.12 
 
 		 776 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  39.89 
 
 		 291 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  38.68 
 
 		 493 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  44.3 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  42.94 
 
 		 745 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  44.51 
 
 		 245 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  41.44 
 
 		 320 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  43.67 
 
 		 401 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  42.94 
 
 		 291 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  44.64 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  36.79 
 
 		 241 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.65 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  45.33 
 
 		 264 aa  90.5  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  42.47 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  42.47 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 		 245 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40.12 
 
 		 517 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  35.5 
 
 		 241 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.81 
 
 		 576 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  43.03 
 
 		 521 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  42.77 
 
 		 311 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  48.32 
 
 		 1033 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.38 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  43.26 
 
 		 268 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  46.56 
 
 		 180 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 		 225 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.88 
 
 		 862 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 		 233 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 		 237 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  41.57 
 
 		 263 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  44.9 
 
 		 184 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  31.32 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  42.95 
 
 		 210 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  35.18 
 
 		 260 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 		 215 aa  86.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  43.05 
 
 		 176 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  43.05 
 
 		 176 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.23 
 
 		 234 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  39.81 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  39.64 
 
 		 215 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  37.71 
 
 		 266 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  37.65 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.58 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.86 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  40.48 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  42.6 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  41.13 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 		 1191 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  35.92 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  43.26 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  40.48 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  41.62 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  42.76 
 
 		 614 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.93 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  35.2 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  45.29 
 
 		 267 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  38.82 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  38.82 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  38.82 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  38.55 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.16 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.49 
 
 		 14916 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  37.74 
 
 		 734 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  44.96 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  44.96 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  40.25 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  44.26 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  37.29 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>