117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6257 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  69.12 
 
 		 286 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  67.72 
 
 		 286 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  66.67 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  49.66 
 
 		 291 aa  258  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  52.8 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  50.37 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  45.45 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  48.24 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  46.58 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  45.88 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  46.21 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.44 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  43.71 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  42.86 
 
 		 324 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  41.81 
 
 		 324 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  43.82 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  43.9 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  44.93 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  44.11 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  44.62 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  43.28 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  43.28 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  43.28 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  45.39 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  42.47 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  42.47 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  42.47 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  41.97 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  41.97 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  41.97 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  43.73 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  43.68 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  41.28 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  39.12 
 
 		 307 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  42.59 
 
 		 272 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  43.58 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  34.7 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  34.09 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  35.23 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.18 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  28.26 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  29.26 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  25.9 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.61 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.68 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  30.18 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  28.62 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  31.27 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  31.27 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  31.27 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  26.18 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  26.84 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  24.91 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  30 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  28.81 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.24 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  32.29 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  27.68 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 347 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.82 
 
 		 334 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 346 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  23.87 
 
 		 343 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  26.99 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  27.4 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  26.12 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  26.12 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  26.12 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.17 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  28.27 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.62 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  27.23 
 
 		 342 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  38.54 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  25.97 
 
 		 342 aa  48.9  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  28.06 
 
 		 347 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  30.77 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  25.55 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  25.55 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  25.46 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  27.99 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.58 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  25.55 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  25.31 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  27.8 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  25.73 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  29.38 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13110  oxidoreductase  26.71 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.4 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  26.04 
 
 		 349 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  24.91 
 
 		 349 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  24.52 
 
 		 360 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  27.82 
 
 		 345 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  25 
 
 		 343 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  25 
 
 		 343 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.71 
 
 		 351 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.17 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>