More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6162 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
434 aa  855  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  72.18 
 
 
435 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  63.79 
 
 
427 aa  505  1e-142  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  60.39 
 
 
431 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  60.7 
 
 
428 aa  482  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.48 
 
 
435 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  63.39 
 
 
450 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  62.32 
 
 
417 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  59.71 
 
 
431 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  55.93 
 
 
434 aa  459  1e-128  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  56.98 
 
 
458 aa  460  1e-128  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  58.91 
 
 
448 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  57.04 
 
 
466 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  58.25 
 
 
429 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  58.35 
 
 
482 aa  445  1e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  57.39 
 
 
458 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  58.64 
 
 
439 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  57 
 
 
448 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  57.39 
 
 
438 aa  440  1e-122  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  59.07 
 
 
480 aa  440  1e-122  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  58.19 
 
 
450 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  58.06 
 
 
435 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  55.48 
 
 
443 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  58.64 
 
 
439 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  58.64 
 
 
439 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  58.01 
 
 
442 aa  415  1e-115  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  54.24 
 
 
424 aa  411  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  53.94 
 
 
418 aa  400  1e-110  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  55.07 
 
 
417 aa  400  1e-110  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  52.51 
 
 
420 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  52.93 
 
 
443 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  49.63 
 
 
420 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  49.14 
 
 
421 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  41.36 
 
 
421 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  40.64 
 
 
426 aa  266  6e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  39.04 
 
 
423 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 
419 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.71 
 
 
405 aa  253  6e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  36.82 
 
 
405 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 
421 aa  246  7e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  34.99 
 
 
405 aa  235  1e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  42.69 
 
 
413 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  37.25 
 
 
411 aa  226  5e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
425 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.63553e-09  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32.69 
 
 
423 aa  216  9e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
419 aa  214  2e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
672 aa  214  3e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
422 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
422 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  39.36 
 
 
405 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.56 
 
 
495 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.56 
 
 
443 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.56 
 
 
499 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.56 
 
 
443 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.56 
 
 
498 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.56 
 
 
443 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.56 
 
 
443 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
426 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  33.17 
 
 
650 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
434 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
438 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
439 aa  199  8e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
438 aa  198  1e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
439 aa  198  2e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
439 aa  198  2e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
426 aa  198  2e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  35.73 
 
 
438 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
437 aa  196  5e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
437 aa  196  5e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
424 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  35.48 
 
 
442 aa  193  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
453 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
440 aa  191  3e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
435 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
422 aa  185  2e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
402 aa  184  4e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  35.7 
 
 
406 aa  183  5e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  38.97 
 
 
1169 aa  182  9e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 
405 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
406 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  38.26 
 
 
397 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  34.76 
 
 
403 aa  176  1e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
430 aa  174  2e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
415 aa  174  4e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
477 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
420 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  34.24 
 
 
407 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
448 aa  148  2e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
408 aa  146  7e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
408 aa  146  7e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
408 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  35.73 
 
 
418 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
396 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
390 aa  131  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  28.73 
 
 
724 aa  129  9e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  30.17 
 
 
406 aa  127  4e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
395 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
400 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.78 
 
 
404 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.48 
 
 
388 aa  123  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>