More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6147 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 214 aa  430  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  89.72 
 
 		 215 aa  394  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  63.51 
 
 		 217 aa  286  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  63.21 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  63.21 
 
 		 219 aa  272  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  61.79 
 
 		 221 aa  271  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  61.32 
 
 		 219 aa  248  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  51.42 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  49.29 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  48.6 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  51.43 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  50.95 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  50.48 
 
 		 222 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  50.48 
 
 		 222 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  50.48 
 
 		 222 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  47.87 
 
 		 224 aa  207  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  48.1 
 
 		 220 aa  207  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  53.77 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  46.73 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  46.95 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  44.29 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  48.82 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  51.43 
 
 		 222 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  54.25 
 
 		 231 aa  195  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  46.7 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  45.97 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  45.62 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  44.29 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  42.18 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  47.2 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.97 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.66 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  45.24 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  41.04 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.62 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  43.13 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  45.24 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  38.1 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  41.04 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.28 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  35.48 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 		 229 aa  111  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 238 aa  111  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  36.82 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  34.4 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  34.09 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  30.28 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  30.33 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  27.62 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.02 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  28.3 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.13 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  29.82 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.75 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  33.64 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  31.28 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  31.28 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  30.58 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.13 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>