More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6131 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 476 aa  915    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  74.9 
 
 		 473 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  50.92 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  51.21 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  48.74 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  49.89 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  49.26 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  47.27 
 
 		 443 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  49.15 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  46.82 
 
 		 458 aa  343  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  47.17 
 
 		 445 aa  339  7e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  47.69 
 
 		 438 aa  335  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  49.02 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  46.78 
 
 		 455 aa  335  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  44.23 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  45.38 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  44.89 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  44.89 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  44.89 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  45.53 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  44.52 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  43.99 
 
 		 448 aa  320  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  42.86 
 
 		 468 aa  319  7e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  46.02 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  44.56 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  36.94 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.24 
 
 		 464 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 		 436 aa  247  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 		 434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  31.82 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  33.55 
 
 		 443 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.4 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  34.57 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.34 
 
 		 441 aa  236  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  33.55 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 		 434 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.42 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  32.32 
 
 		 434 aa  226  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 434 aa  226  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 		 443 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  32.96 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.22 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  32.63 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  26.82 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  34.87 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  30.39 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  31.08 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 		 440 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  31.22 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  30.77 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  31.76 
 
 		 442 aa  193  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  36.63 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  32.64 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  32.64 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  32.64 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.97 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  32.41 
 
 		 416 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.11 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  29.49 
 
 		 422 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  30.54 
 
 		 421 aa  189  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  33.91 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.64 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  30.97 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  28.91 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  30.72 
 
 		 425 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  30.6 
 
 		 426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  30.61 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  30.61 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  30.61 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  30.61 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  31.66 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>