More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6117 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 396 aa  770    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  70.32 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  45.28 
 
 		 378 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.19 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  52.36 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.9 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  51.54 
 
 		 320 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  50 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.39 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.04 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.58 
 
 		 321 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.15 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  48.78 
 
 		 328 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  49.83 
 
 		 327 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  51.16 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  50 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  47.75 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  47.12 
 
 		 324 aa  240  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  45.39 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  45.39 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  45.39 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.99 
 
 		 330 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  48.64 
 
 		 326 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  48.64 
 
 		 326 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  48.64 
 
 		 326 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  48.25 
 
 		 326 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.97 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.13 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.09 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  36.25 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  39.39 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  37.81 
 
 		 366 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  37.81 
 
 		 366 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  37.81 
 
 		 366 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  37.84 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.25 
 
 		 360 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  45.28 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  45.31 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  45.31 
 
 		 325 aa  209  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.56 
 
 		 340 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.67 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.61 
 
 		 321 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  39.53 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  45.1 
 
 		 276 aa  199  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.02 
 
 		 271 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.24 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.96 
 
 		 271 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  42.74 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  40 
 
 		 271 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  41.87 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  42.21 
 
 		 285 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  38.67 
 
 		 271 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.82 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.63 
 
 		 284 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.79 
 
 		 283 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  38.31 
 
 		 278 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  37.26 
 
 		 283 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  38.67 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  41.15 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.22 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  36.88 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  42.37 
 
 		 284 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  41.53 
 
 		 284 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.74 
 
 		 282 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.72 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.82 
 
 		 282 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.65 
 
 		 272 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  40.61 
 
 		 283 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.66 
 
 		 390 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  42.42 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.33 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.82 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.86 
 
 		 258 aa  146  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.03 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.5 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.79 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.43 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.79 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  38.46 
 
 		 401 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  38.46 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  38.03 
 
 		 352 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  39.91 
 
 		 395 aa  142  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.43 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  36.05 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  35.96 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  34.02 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  33.19 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  35.55 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.23 
 
 		 454 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.56 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  35.32 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  34.41 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  41.34 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.75 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  36.86 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  36.75 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.75 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  36.75 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  32.07 
 
 		 351 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  36.75 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>