170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6068 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 399 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  74.14 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  49.75 
 
 		 245 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  36.89 
 
 		 574 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  37.32 
 
 		 348 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  37.93 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.84 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  38.6 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.84 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  35.41 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 		 829 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  38.42 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  35.75 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  34.11 
 
 		 272 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  37.62 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  35.32 
 
 		 241 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  39.15 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  34.26 
 
 		 272 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  33.18 
 
 		 272 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  38.42 
 
 		 283 aa  110  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  35.16 
 
 		 250 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  33.8 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  33.8 
 
 		 272 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  33.18 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  34.12 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  33.18 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  33.33 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  33.16 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  32.46 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  33.16 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  32.05 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  36.41 
 
 		 216 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  33.5 
 
 		 935 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  34.85 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  31.22 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 		 294 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  35.02 
 
 		 287 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  31.22 
 
 		 345 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  35.27 
 
 		 265 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  34.33 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  42.24 
 
 		 967 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 216 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  41.56 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  34.56 
 
 		 282 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  35.75 
 
 		 265 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 		 355 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  31.5 
 
 		 235 aa  99.8  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  32.62 
 
 		 282 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  33.95 
 
 		 263 aa  99.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  41.45 
 
 		 1040 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  34.68 
 
 		 266 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  32.99 
 
 		 342 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  32.55 
 
 		 255 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  30.99 
 
 		 286 aa  97.4  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  33.49 
 
 		 313 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 260 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  39.29 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.49 
 
 		 892 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  35.55 
 
 		 248 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  33.17 
 
 		 267 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 263 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 263 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 		 628 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  29.17 
 
 		 257 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  38.04 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  30.35 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  34.89 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  30.39 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  32.46 
 
 		 240 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  34.3 
 
 		 263 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  31.56 
 
 		 249 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  35.32 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 279 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  38.89 
 
 		 695 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  30.37 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  37.41 
 
 		 595 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  39.61 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  36.11 
 
 		 928 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  34.08 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.33 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.96 
 
 		 846 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  32.69 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  36.81 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  39.49 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  29.52 
 
 		 249 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  35.07 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0485  glycoside hydrolase family protein  31.87 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  38.46 
 
 		 546 aa  77.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  31.41 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  35.87 
 
 		 654 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  30.29 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  27.32 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  34.84 
 
 		 867 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.17 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>