More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6061 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  95.14 
 
 		 144 aa  257  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  82.64 
 
 		 143 aa  244  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  81.69 
 
 		 142 aa  240  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  82.39 
 
 		 143 aa  236  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  80.99 
 
 		 144 aa  236  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  82.39 
 
 		 143 aa  235  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  81.56 
 
 		 143 aa  234  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  81.69 
 
 		 143 aa  233  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  78.47 
 
 		 144 aa  233  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  81.69 
 
 		 143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  78.87 
 
 		 143 aa  231  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  80.28 
 
 		 142 aa  228  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  81.16 
 
 		 143 aa  228  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  80.43 
 
 		 142 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  81.16 
 
 		 143 aa  228  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  80.43 
 
 		 142 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  76.09 
 
 		 143 aa  227  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 		 142 aa  227  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  81.16 
 
 		 143 aa  226  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  80.43 
 
 		 142 aa  226  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  76.76 
 
 		 142 aa  225  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  77.08 
 
 		 143 aa  225  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  75 
 
 		 144 aa  224  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  78.26 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  77.3 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  76.76 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  73.94 
 
 		 142 aa  215  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 		 143 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  72.54 
 
 		 142 aa  210  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  72.22 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  70.42 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  70.42 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  71.22 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  73.19 
 
 		 143 aa  207  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  69.34 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  71.74 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 141 aa  203  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 141 aa  203  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  75.35 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  200  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  69.34 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 141 aa  193  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  190  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  64.23 
 
 		 163 aa  190  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  189  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  189  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  64.96 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 144 aa  186  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>