More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6052 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  60.52 
 
 
691 aa  849  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3670  elongation factor G  60.99 
 
 
690 aa  883  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  61.95 
 
 
704 aa  886  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0853  elongation factor G  61.57 
 
 
707 aa  893  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.367581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  64.54 
 
 
692 aa  935  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  61.59 
 
 
704 aa  877  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.62154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  59.94 
 
 
693 aa  845  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  60.84 
 
 
691 aa  876  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  63.27 
 
 
691 aa  911  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  60.51 
 
 
723 aa  884  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  63.06 
 
 
700 aa  900  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  6.46434e-05  hitchhiker  4.15866e-10 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  62.26 
 
 
701 aa  878  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  62.34 
 
 
700 aa  872  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  60.94 
 
 
704 aa  866  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.97299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  62.48 
 
 
700 aa  895  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  62.75 
 
 
701 aa  882  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  61.74 
 
 
703 aa  870  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47912e-07 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  61.14 
 
 
704 aa  872  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.38261e-05  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  61.01 
 
 
704 aa  874  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3716  elongation factor G  60.66 
 
 
704 aa  848  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0927216  normal  0.0969109 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  62.52 
 
 
692 aa  889  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11189  predicted protein  59.48 
 
 
729 aa  846  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  61.34 
 
 
698 aa  854  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  5.05947e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3341  elongation factor G  61.71 
 
 
699 aa  867  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  5.27224e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  62.5 
 
 
691 aa  868  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  62.52 
 
 
692 aa  890  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.90247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1329  elongation factor G  60.93 
 
 
699 aa  862  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250131  normal  0.0892701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  60.94 
 
 
704 aa  866  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.44499e-07  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  60.78 
 
 
699 aa  859  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3814  elongation factor G  60.66 
 
 
704 aa  848  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3643  elongation factor G  60.66 
 
 
704 aa  848  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.61479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  63.73 
 
 
692 aa  923  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  64.44 
 
 
697 aa  910  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  59.68 
 
 
692 aa  853  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3642  elongation factor G  60.66 
 
 
704 aa  848  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156207  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3751  elongation factor G  60.66 
 
 
704 aa  848  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.491712  normal  0.0846164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  62.7 
 
 
700 aa  894  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  61.39 
 
 
700 aa  858  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.9839e-09  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  61.96 
 
 
700 aa  870  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  61.34 
 
 
698 aa  854  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  1.82182e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  62.98 
 
 
701 aa  860  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  73.89 
 
 
698 aa  1064  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  100 
 
 
698 aa  1432  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  61.47 
 
 
698 aa  840  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.44622e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  61.73 
 
 
704 aa  880  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.85563e-08  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2537  translation elongation factor G  60.89 
 
 
701 aa  876  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4320  elongation factor G  62.05 
 
 
698 aa  842  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.82121e-06  unclonable  2.47136e-10 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  60.94 
 
 
704 aa  866  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.25417e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  60.94 
 
 
704 aa  866  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.52954e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  63.43 
 
 
699 aa  852  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  61.17 
 
 
701 aa  846  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  4.45234e-07 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  62.34 
 
 
699 aa  897  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  61.28 
 
 
691 aa  881  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  64.66 
 
 
691 aa  921  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  58.95 
 
 
691 aa  840  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.61111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  59.89 
 
 
705 aa  866  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  61.1 
 
 
702 aa  869  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  61.86 
 
 
700 aa  895  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  61.14 
 
 
691 aa  888  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  62.17 
 
 
703 aa  875  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  62.55 
 
 
700 aa  894  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  60.12 
 
 
691 aa  873  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  60.94 
 
 
704 aa  866  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.94361e-06  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  60.94 
 
 
704 aa  866  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.19107e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  64.07 
 
 
702 aa  904  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.12388e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  61.77 
 
 
689 aa  874  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0803  elongation factor G  59.59 
 
 
692 aa  852  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.468644  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  62.59 
 
 
689 aa  901  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  62.37 
 
 
692 aa  886  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  60.7 
 
 
691 aa  879  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  64.07 
 
 
702 aa  904  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.79981e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  62.34 
 
 
699 aa  899  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  62.32 
 
 
701 aa  874  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20192e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  62.26 
 
 
700 aa  890  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  60.72 
 
 
692 aa  894  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  61.25 
 
 
692 aa  865  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  62.52 
 
 
706 aa  884  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  63.19 
 
 
699 aa  858  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.15857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3804  translation elongation factor G  69.04 
 
 
701 aa  1012  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  63.73 
 
 
699 aa  874  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.39347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4007  elongation factor G  60.52 
 
 
704 aa  848  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.80538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  62.59 
 
 
689 aa  892  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  62.99 
 
 
690 aa  868  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  70.77 
 
 
698 aa  1002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  59.09 
 
 
689 aa  840  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  64.45 
 
 
691 aa  921  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  64.35 
 
 
691 aa  904  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  62.04 
 
 
705 aa  872  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  7.93105e-13 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  62.95 
 
 
698 aa  882  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.82661e-07  hitchhiker  1.23904e-06 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  67.29 
 
 
699 aa  984  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  62.02 
 
 
689 aa  869  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23880  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  63.88 
 
 
715 aa  924  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0292811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  74.68 
 
 
703 aa  1104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  62.52 
 
 
692 aa  900  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  63.1 
 
 
691 aa  900  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  70.45 
 
 
704 aa  1028  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  77.14 
 
 
700 aa  1129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  68.47 
 
 
701 aa  1002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  69.57 
 
 
700 aa  1009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  69.96 
 
 
699 aa  1017  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>