More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6041 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 83 aa  163  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  82.35 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  71.83 
 
 		 76 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  71.23 
 
 		 77 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  71.23 
 
 		 77 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  73.53 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  69.01 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  75.38 
 
 		 83 aa  97.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  65.75 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  72.31 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  65.75 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  65.75 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  64.94 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  60.24 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  62.96 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  60.76 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  69.84 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  66.18 
 
 		 79 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  66.67 
 
 		 80 aa  90.9  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  63.77 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  72.31 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3915  50S ribosomal protein L29  77.78 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4307  50S ribosomal protein L29  77.78 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243874  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6606  ribosomal protein L29  79.25 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  63.01 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  52.87 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  69.49 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  68.85 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  58.23 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  57.89 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  56.58 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  53.95 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  55.26 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  67.19 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  53.85 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0595  ribosomal protein L29  65.52 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  66.13 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  63.16 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  52.56 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  58.46 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  59.02 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  60.34 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  57.38 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  53.23 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  57.63 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  57.63 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 		 67 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  58.62 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  58.62 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  58.06 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  58.06 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  58.62 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  57.38 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  58.62 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  47.76 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  47.76 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  55.17 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  54.39 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  51.72 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  48.48 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  52.38 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  55.17 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>