More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6007 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
287 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  56.78 
 
 
254 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  44.35 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  44.11 
 
 
231 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  45.42 
 
 
210 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  43.97 
 
 
243 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  53.59 
 
 
230 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  42.13 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  41.73 
 
 
218 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  41.73 
 
 
211 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  41.73 
 
 
211 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  41.79 
 
 
232 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  42.13 
 
 
210 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  39.62 
 
 
207 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  46.33 
 
 
225 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  43.01 
 
 
240 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  40 
 
 
224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  39.92 
 
 
227 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  48.75 
 
 
191 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  43.85 
 
 
225 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  40.77 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  41.46 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  41.6 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  41.29 
 
 
216 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  40.36 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  37.68 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  40.29 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  36.36 
 
 
212 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  47.78 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  38.93 
 
 
212 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  38.29 
 
 
225 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  39.13 
 
 
222 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  42.61 
 
 
223 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  46.67 
 
 
223 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  27.69 
 
 
236 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  47.57 
 
 
244 aa  85.9  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  35.94 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  35.42 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  41.54 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  31.67 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  32.52 
 
 
222 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  32.52 
 
 
222 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  30.51 
 
 
234 aa  79  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  34.64 
 
 
231 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  34.64 
 
 
231 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  34.64 
 
 
231 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  32.14 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  34.08 
 
 
231 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  34.08 
 
 
231 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  34.64 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  34.27 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  34.08 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  34.27 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  35.16 
 
 
235 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  32.4 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  32.96 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  34.46 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  32.22 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  32.4 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  32.4 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  32.4 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  32.4 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  32.4 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  32.04 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  32.4 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  32.04 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  32.4 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  32.04 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  29.88 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  32.18 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  31.94 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  36.26 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  31.94 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1344  peptidase M22 glycoprotease  36.43 
 
 
177 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309831  normal  0.0951172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  32.59 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0231  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  31.94 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  32.37 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  25.9 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  30.1 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  31.94 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  32.58 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  32.58 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  31.87 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  28 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  0.00000000126844 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  34.97 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  31.94 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  31.94 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  32.89 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  31.94 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  33.5 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  37.35 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  36.57 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  35.03 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0244  peptidase M22 glycoprotease  32.58 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  34.25 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  30.89 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  30.94 
 
 
233 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  38.35 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  31.84 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>