More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5969 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 409 aa  785    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  74.75 
 
 		 406 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  59.25 
 
 		 403 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  53.41 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  54.55 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  52.41 
 
 		 373 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  33.66 
 
 		 398 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  35.73 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  31.77 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  29.38 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  32.47 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  33.15 
 
 		 393 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  34.7 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  32.08 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  33.5 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  32.11 
 
 		 425 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 		 423 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  30.54 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  33.16 
 
 		 418 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  32.33 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  32.33 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  32.33 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  32.18 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  34.7 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 376 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  32.31 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  39.02 
 
 		 429 aa  119  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  32.37 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  33.81 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  34.1 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  33.64 
 
 		 440 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  32.74 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  33.88 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.15 
 
 		 375 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  32.87 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  30.7 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.87 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  32.42 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  32.55 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  33.22 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  29.4 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  32.55 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  34.33 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  31.37 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  30.92 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  30.7 
 
 		 443 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  31.61 
 
 		 444 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.57 
 
 		 387 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  32.87 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 415 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  27.86 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  31.08 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 389 aa  92.8  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  32.92 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  33.02 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.47 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  32.09 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  31.42 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  30.35 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  30.64 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 367 aa  87  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  31.48 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  31.46 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.33 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  30.92 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  30.22 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  32.91 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  30.25 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.65 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  34.45 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  32.72 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  30.94 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.51 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  31.72 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  31.5 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  30.94 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>