More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5894 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
382 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  67.48 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  51.05 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  48.81 
 
 
361 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  47.94 
 
 
373 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  48.29 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  41.88 
 
 
367 aa  202  6e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 
381 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 
400 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
384 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 
384 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  35.25 
 
 
375 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  35.84 
 
 
375 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 
376 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
381 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
387 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
387 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35.36 
 
 
397 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
364 aa  137  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
340 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  34.34 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  40.64 
 
 
471 aa  126  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
381 aa  126  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
393 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
371 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
366 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
355 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 
366 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
377 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
373 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
360 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  26.91 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
434 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
382 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
377 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  23.17 
 
 
375 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
381 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  32.57 
 
 
373 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  31.31 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  29.38 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  23.04 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
435 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  36.62 
 
 
379 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.59 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.46 
 
 
351 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
418 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
366 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
376 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
395 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
360 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  35.02 
 
 
346 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  35.02 
 
 
346 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
380 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
366 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
464 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
381 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
364 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
417 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
380 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
364 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.14 
 
 
361 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
369 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
431 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
372 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  23.86 
 
 
354 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.13 
 
 
373 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  23.54 
 
 
381 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
370 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  34.52 
 
 
412 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
361 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 
423 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
394 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
359 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
361 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>