More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5881 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  84.75 
 
 
237 aa  400  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  64.35 
 
 
235 aa  295  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  65.22 
 
 
233 aa  278  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.39 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.36 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  40.68 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.19 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
264 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  31.28 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  31.28 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.82 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  42.2 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.27 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  31.52 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  36.89 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  28.7 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
289 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.68 
 
 
200 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
247 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  40 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
1106 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  36.28 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.18 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.28 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.47 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_345  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.68 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  38.05 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  41.9 
 
 
347 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.28 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  37.4 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.8 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  27.44 
 
 
199 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
200 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  26.38 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
362 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
293 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.91 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.24 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  37.67 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  26.83 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  26.22 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.51 
 
 
258 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  41.59 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  39.09 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  26.83 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.37 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.82 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
269 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.83 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
261 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  29.37 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 
266 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.11 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.39 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.24 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.38 
 
 
277 aa  58.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  26.22 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
256 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.11 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
241 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 
277 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  33.62 
 
 
267 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  33.62 
 
 
267 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  25.75 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  26.15 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.39 
 
 
256 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  35.61 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  32.24 
 
 
309 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  38.83 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.68 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>