More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5877 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
303 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  82.19 
 
 
326 aa  457  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  53.29 
 
 
310 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  54.61 
 
 
288 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  51.82 
 
 
297 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  53.41 
 
 
285 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  50.75 
 
 
301 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  48.77 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  48.77 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  48.77 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  46.43 
 
 
307 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  45.65 
 
 
305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  46.04 
 
 
291 aa  242  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  47.52 
 
 
301 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  38.19 
 
 
281 aa  139  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
312 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
324 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.18 
 
 
318 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
318 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
401 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
306 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
324 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
311 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
293 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
274 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  23.55 
 
 
297 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
290 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
334 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 
324 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  23.19 
 
 
297 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
298 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
307 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  26.6 
 
 
652 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
289 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  28.51 
 
 
320 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 
310 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
329 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.41 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
355 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
359 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
337 aa  95.5  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  26.1 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  26.69 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
313 aa  94  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
318 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
318 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
340 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  23.44 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 
346 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  28.78 
 
 
348 aa  90.1  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
360 aa  89.7  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.47 
 
 
907 aa  89  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.08 
 
 
358 aa  88.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 
705 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.91 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
361 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
306 aa  87  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
353 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
328 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
841 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  31.89 
 
 
884 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.56 
 
 
1644 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.56 
 
 
1644 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.07 
 
 
2401 aa  85.9  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.66 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
1739 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>