More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5876 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 357 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  84.27 
 
 		 357 aa  547  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  67.04 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  64.79 
 
 		 364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  62.64 
 
 		 364 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  62.54 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  61.6 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  63.38 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  60 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  59.44 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  58.87 
 
 		 359 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  58.87 
 
 		 359 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  58.87 
 
 		 359 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  57.46 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  59.43 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0451  nucleotidyl transferase  62.39 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  56.18 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  56.34 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  36.9 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  36.9 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  39.22 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  36.41 
 
 		 361 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  36.41 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  41.67 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  35.6 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  38.61 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  35.36 
 
 		 821 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  33.42 
 
 		 835 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  33.6 
 
 		 834 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  33.86 
 
 		 841 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  32.98 
 
 		 832 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  32.98 
 
 		 832 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.42 
 
 		 828 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  36.69 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  32.55 
 
 		 833 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  34.06 
 
 		 827 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  36.56 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  33.24 
 
 		 830 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  29.38 
 
 		 810 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  33.87 
 
 		 818 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  31.39 
 
 		 816 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  30.46 
 
 		 820 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  32.81 
 
 		 832 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 830 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  28.12 
 
 		 828 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  35.44 
 
 		 854 aa  195  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.1 
 
 		 842 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  28.46 
 
 		 712 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  28.65 
 
 		 827 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.21 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  35.6 
 
 		 843 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  32.09 
 
 		 835 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.89 
 
 		 837 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  31.13 
 
 		 835 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  30.95 
 
 		 842 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.5 
 
 		 776 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  31.83 
 
 		 843 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  32.01 
 
 		 828 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  30.85 
 
 		 840 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.48 
 
 		 836 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  32.98 
 
 		 833 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  28.5 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.48 
 
 		 836 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.79 
 
 		 842 aa  185  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  31.04 
 
 		 820 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  31.99 
 
 		 842 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  36.34 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  32.98 
 
 		 828 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 		 835 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  31.85 
 
 		 836 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  31.75 
 
 		 784 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  31.75 
 
 		 784 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  30.03 
 
 		 818 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  32.34 
 
 		 784 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  32.05 
 
 		 784 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  32.05 
 
 		 784 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  32.34 
 
 		 784 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  31.45 
 
 		 784 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  32.66 
 
 		 364 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.05 
 
 		 784 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  29.49 
 
 		 841 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.75 
 
 		 784 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  31.75 
 
 		 784 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  33.24 
 
 		 346 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  32.97 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  29.02 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  28.15 
 
 		 836 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  28.23 
 
 		 785 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  29.14 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  33.06 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  27.97 
 
 		 392 aa  169  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.19 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.35 
 
 		 397 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  28.34 
 
 		 387 aa  166  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.34 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  27.35 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.66 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>