30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5822 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  100 
 
 		 152 aa  298  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0783  TadE-like  76.27 
 
 		 171 aa  159  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  41.67 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1256  TadE family protein  44.26 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266126  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  65.22 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1213  TadE family protein  42.31 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1029  TadE family protein  40.15 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20380  hypothetical protein  35.14 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2787  TadE family protein  45.16 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  hitchhiker  0.000960754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10360  hypothetical protein  34.91 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07540  TadE-like protein  29.51 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  32.43 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  28.57 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  47.73 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  34.43 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  39.62 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  41.51 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  39.29 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  29.36 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  39.29 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  39.29 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  32.14 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  25.23 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  39.62 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  27.27 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  27.27 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  27.27 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  27.27 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>