More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5761 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  100 
 
 
438 aa  864    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3615  aminotransferase class-III  55.72 
 
 
426 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  49.25 
 
 
453 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.76 
 
 
459 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.13 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  37.89 
 
 
429 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  40.05 
 
 
411 aa  289  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  37.89 
 
 
459 aa  288  9e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  37.89 
 
 
468 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.89 
 
 
429 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.89 
 
 
429 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.89 
 
 
459 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.89 
 
 
429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.89 
 
 
459 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.89 
 
 
459 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.1 
 
 
472 aa  285  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.65 
 
 
459 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.65 
 
 
459 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.65 
 
 
459 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  39.7 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.35 
 
 
457 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.32 
 
 
477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  42.78 
 
 
472 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.62 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  34.19 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  34.67 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  37.53 
 
 
463 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  37.67 
 
 
467 aa  243  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  38.04 
 
 
475 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.54 
 
 
450 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  35.9 
 
 
460 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  33.86 
 
 
394 aa  223  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  33.86 
 
 
394 aa  223  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  37.14 
 
 
392 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  35.93 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  38.68 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.52 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.34 
 
 
391 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.17 
 
 
398 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  34.84 
 
 
396 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  34.84 
 
 
396 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
460 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  34.84 
 
 
396 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  34.57 
 
 
396 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  34.57 
 
 
396 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  34.57 
 
 
396 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  33.9 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  34.31 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.77 
 
 
393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  37.7 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  37.99 
 
 
402 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  37.99 
 
 
402 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  34.04 
 
 
396 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  38.14 
 
 
412 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  34.53 
 
 
390 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  43.52 
 
 
845 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  34.04 
 
 
396 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  33.78 
 
 
396 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  35.87 
 
 
406 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  34.29 
 
 
415 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  36.26 
 
 
468 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  33.26 
 
 
462 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  35.16 
 
 
427 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  34.76 
 
 
399 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  33.33 
 
 
396 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  34.76 
 
 
396 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  32.66 
 
 
398 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  33.33 
 
 
396 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  33.33 
 
 
397 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  35.93 
 
 
399 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0325  aminotransferase class-III  38.46 
 
 
382 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.98 
 
 
397 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  37.63 
 
 
399 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  35.98 
 
 
401 aa  206  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  31.1 
 
 
460 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  32.58 
 
 
397 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.56 
 
 
388 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  33.24 
 
 
396 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  31.55 
 
 
398 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  36.87 
 
 
390 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  36.79 
 
 
427 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  34.5 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  36.6 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  39.78 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  35.98 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  37.03 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  32.24 
 
 
458 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  36.96 
 
 
457 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  34.67 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.45 
 
 
402 aa  200  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  35.26 
 
 
376 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  36.57 
 
 
404 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  35.34 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  35.2 
 
 
463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  31.73 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2551  aminotransferase class-III  35.45 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  34.19 
 
 
385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  36.08 
 
 
680 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  35.52 
 
 
457 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  35.71 
 
 
375 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>