268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5724 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  38.99 
 
 		 1314 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  39.92 
 
 		 1324 aa  883    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 1309 aa  2641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  36.59 
 
 		 1311 aa  690    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  37.83 
 
 		 845 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  37.75 
 
 		 849 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  33.31 
 
 		 1326 aa  476  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  35.92 
 
 		 1500 aa  453  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  35.48 
 
 		 843 aa  439  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  35.49 
 
 		 1383 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  34.34 
 
 		 838 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  60.07 
 
 		 1046 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  34.64 
 
 		 859 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  35.08 
 
 		 897 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  33.86 
 
 		 900 aa  369  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  34.83 
 
 		 992 aa  365  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  37.16 
 
 		 1000 aa  341  7e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  32.89 
 
 		 1509 aa  333  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  35.39 
 
 		 829 aa  327  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1068 aa  324  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1523 aa  323  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  35.14 
 
 		 675 aa  280  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.41 
 
 		 899 aa  276  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  30.51 
 
 		 934 aa  274  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  29.32 
 
 		 963 aa  265  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 785 aa  256  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1010 aa  255  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 911 aa  251  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  28.6 
 
 		 1056 aa  251  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  27.94 
 
 		 1261 aa  226  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1039 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.11 
 
 		 1050 aa  182  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.43 
 
 		 1262 aa  181  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.47 
 
 		 1185 aa  179  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  28.32 
 
 		 713 aa  165  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1088 aa  160  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  27.7 
 
 		 801 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1017 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1283 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 		 1288 aa  150  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1105 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  24.47 
 
 		 1128 aa  147  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  31.9 
 
 		 385 aa  144  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.42 
 
 		 1131 aa  142  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  28.82 
 
 		 686 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 1424 aa  139  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  23.47 
 
 		 1125 aa  137  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 924 aa  132  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  23.74 
 
 		 1146 aa  124  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 		 1136 aa  122  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 857 aa  122  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  28.79 
 
 		 457 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  34.77 
 
 		 373 aa  112  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  32.86 
 
 		 472 aa  109  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  33.5 
 
 		 476 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  25.09 
 
 		 793 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  25.06 
 
 		 1468 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  25.65 
 
 		 1488 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 953 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 		 767 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1212 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 814 aa  103  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 		 1186 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 966 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 850 aa  98.6  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  23.64 
 
 		 1044 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 837 aa  93.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  27.68 
 
 		 958 aa  87.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  19.43 
 
 		 1404 aa  86.7  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  23.35 
 
 		 672 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  24.42 
 
 		 577 aa  84  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  30.23 
 
 		 902 aa  81.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  24.43 
 
 		 828 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.46 
 
 		 822 aa  80.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1215 aa  80.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.59 
 
 		 568 aa  79.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 568 aa  79.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 652 aa  79  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 		 991 aa  78.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1017 aa  77  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 454 aa  76.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  32.45 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  25.5 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.76 
 
 		 841 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 776 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  28.63 
 
 		 392 aa  74.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  29.83 
 
 		 633 aa  73.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.73 
 
 		 1328 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 843 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  29.44 
 
 		 1025 aa  73.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.62 
 
 		 911 aa  73.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  29.81 
 
 		 909 aa  72.4  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  38.38 
 
 		 705 aa  72.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  31.4 
 
 		 374 aa  72  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  32.16 
 
 		 888 aa  71.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 640 aa  71.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 751 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  28.27 
 
 		 894 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  24.05 
 
 		 965 aa  70.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>