More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5601 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 538 aa  1018    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0941  FAD dependent oxidoreductase  68.62 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0194279  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  61.69 
 
 		 522 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1796  FAD dependent oxidoreductase  61.32 
 
 		 518 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00246275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  58.97 
 
 		 508 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  57.99 
 
 		 520 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4592  FAD dependent oxidoreductase  59.06 
 
 		 523 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00758706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2773  FAD dependent oxidoreductase  60.46 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114338  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.35 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  57.5 
 
 		 516 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  53.48 
 
 		 519 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  60.08 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3759  FAD dependent oxidoreductase  53.44 
 
 		 517 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12278  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD1  51.7 
 
 		 516 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4837  FAD dependent oxidoreductase  52.55 
 
 		 510 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3372  FAD dependent oxidoreductase  53.86 
 
 		 518 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.581331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3383  FAD dependent oxidoreductase  53.86 
 
 		 518 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3434  FAD dependent oxidoreductase  53.86 
 
 		 518 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  51.74 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  41.87 
 
 		 574 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.67 
 
 		 585 aa  282  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 603 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 572 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 578 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.06 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 560 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  39.34 
 
 		 559 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 559 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.85 
 
 		 567 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 		 577 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 		 600 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  38.51 
 
 		 583 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.32 
 
 		 554 aa  266  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  42.1 
 
 		 639 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  38.51 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 		 584 aa  264  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 		 575 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  39.6 
 
 		 559 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 573 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 582 aa  263  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 559 aa  263  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  39.04 
 
 		 579 aa  260  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  41.5 
 
 		 574 aa  259  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 525 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 		 582 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 567 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 573 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  38.91 
 
 		 568 aa  256  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 		 576 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 516 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 		 582 aa  253  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  39.46 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 582 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  40.99 
 
 		 603 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  41.25 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 		 595 aa  250  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 562 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  39.85 
 
 		 581 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  40.16 
 
 		 524 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.3 
 
 		 587 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 		 579 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 		 579 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 579 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 537 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.66 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 566 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 519 aa  243  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  41.28 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 543 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 		 582 aa  239  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 		 536 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  37.12 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.76 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 569 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  39.35 
 
 		 534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 		 593 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 556 aa  233  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 546 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 537 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  38.87 
 
 		 585 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 542 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 		 519 aa  229  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  38.8 
 
 		 528 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 		 529 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  38.07 
 
 		 539 aa  226  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 		 550 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 518 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 543 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  42.21 
 
 		 583 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.73 
 
 		 591 aa  220  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 532 aa  220  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 532 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 546 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 581 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  31.84 
 
 		 700 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 		 533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  29.3 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>