116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5600 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 197 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 197 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 200 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  42.98 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  48.4 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 192 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 208 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  39.89 
 
 		 189 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  38.02 
 
 		 211 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 196 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 197 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  34.48 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 191 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  55.32 
 
 		 188 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.82 
 
 		 204 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 195 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 197 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2597  hypothetical protein  26.16 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323808  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 230 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 213 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 202 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 203 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 216 aa  45.4  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  31.72 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 192 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 195 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 195 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 190 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  45.83 
 
 		 203 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 218 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 190 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 190 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 214 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>