More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5599 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 572 aa  1106    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  64.87 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  59.21 
 
 		 528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  54.26 
 
 		 532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  53.42 
 
 		 527 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.4 
 
 		 521 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  51.34 
 
 		 529 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  53.42 
 
 		 525 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  53.42 
 
 		 525 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  53.42 
 
 		 525 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  55.88 
 
 		 521 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  52.16 
 
 		 527 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  55.22 
 
 		 520 aa  478  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  54.66 
 
 		 524 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.63 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  52.07 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  49.35 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  51.52 
 
 		 550 aa  415  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.89 
 
 		 534 aa  398  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  39.24 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.92 
 
 		 531 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  35.83 
 
 		 583 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  32.34 
 
 		 563 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.91 
 
 		 568 aa  317  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  37.83 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  37.94 
 
 		 531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  37.43 
 
 		 552 aa  313  6.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.4 
 
 		 534 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  37.06 
 
 		 538 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.7 
 
 		 565 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 		 554 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  41.32 
 
 		 546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  35.51 
 
 		 584 aa  279  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 		 557 aa  276  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  34.48 
 
 		 559 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.15 
 
 		 536 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.28 
 
 		 535 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 		 579 aa  246  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.42 
 
 		 586 aa  239  9e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  35.42 
 
 		 527 aa  236  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  34.01 
 
 		 534 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  34.01 
 
 		 502 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 564 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  32.81 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  33.95 
 
 		 532 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  34 
 
 		 532 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  34.98 
 
 		 531 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.33 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  34.87 
 
 		 572 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  34.62 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  31.07 
 
 		 465 aa  200  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.27 
 
 		 510 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.97 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.93 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  27.13 
 
 		 484 aa  173  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.97 
 
 		 516 aa  170  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  31.18 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  30.18 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  27.86 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  27.86 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  27.86 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  28.74 
 
 		 513 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  27.67 
 
 		 484 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  27.67 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  27.67 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 		 523 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  27.48 
 
 		 484 aa  160  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.41 
 
 		 516 aa  160  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  25.81 
 
 		 451 aa  134  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  23.65 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.75 
 
 		 890 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  24.95 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.87 
 
 		 477 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  25.97 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.34 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  24.09 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.04 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.98 
 
 		 459 aa  113  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  27.2 
 
 		 466 aa  113  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.45 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1170  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.33 
 
 		 529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  28.98 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  28.24 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  28.75 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.49 
 
 		 461 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  23.12 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 453 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  27.54 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  23.48 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  25.49 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  29.4 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  23.12 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  28.02 
 
 		 499 aa  107  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  22.96 
 
 		 466 aa  107  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.21 
 
 		 887 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  28.39 
 
 		 462 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.47 
 
 		 485 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>