More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5592 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  62.43 
 
 
734 aa  863    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
721 aa  1432    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  68.42 
 
 
865 aa  343  7e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60.87 
 
 
833 aa  335  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  57.88 
 
 
932 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  60.61 
 
 
641 aa  310  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60.38 
 
 
898 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.94 
 
 
806 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  58.49 
 
 
835 aa  302  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60.81 
 
 
828 aa  301  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  37 
 
 
676 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  55.22 
 
 
612 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.87 
 
 
585 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  45.87 
 
 
555 aa  280  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  52.72 
 
 
624 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  53.82 
 
 
520 aa  277  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  49.32 
 
 
644 aa  272  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  52.71 
 
 
573 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  49.24 
 
 
528 aa  270  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  55.73 
 
 
729 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.67 
 
 
569 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  55.51 
 
 
613 aa  268  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  47.09 
 
 
771 aa  265  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  49.83 
 
 
586 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  54.87 
 
 
723 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  52.55 
 
 
611 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
624 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 
455 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  55.89 
 
 
520 aa  255  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
589 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.73 
 
 
599 aa  254  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.23 
 
 
814 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.52 
 
 
421 aa  251  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  46.35 
 
 
608 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  51.77 
 
 
652 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  50.95 
 
 
716 aa  247  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  47.64 
 
 
481 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  54.9 
 
 
616 aa  244  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  47.3 
 
 
694 aa  244  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
695 aa  244  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.41 
 
 
481 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  48.65 
 
 
535 aa  243  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  47.18 
 
 
604 aa  243  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 
820 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  48.43 
 
 
569 aa  241  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.05 
 
 
751 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  48.45 
 
 
564 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.56 
 
 
490 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  48.18 
 
 
637 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  47.73 
 
 
547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  49.42 
 
 
637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
680 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 
646 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  48.69 
 
 
541 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  45.55 
 
 
638 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
542 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  46.46 
 
 
594 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
560 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.44 
 
 
608 aa  229  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  44.16 
 
 
292 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.03 
 
 
557 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  47.71 
 
 
644 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0669  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.43 
 
 
975 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0315888  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.96 
 
 
600 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.13 
 
 
687 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  46.33 
 
 
601 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
360 aa  227  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  53.61 
 
 
597 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  47.22 
 
 
571 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  46.05 
 
 
560 aa  225  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  49.8 
 
 
551 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  47.73 
 
 
548 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.65 
 
 
587 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  47.91 
 
 
522 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  43.14 
 
 
544 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.91 
 
 
716 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  49.05 
 
 
837 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.36 
 
 
673 aa  220  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.13 
 
 
603 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  43.46 
 
 
870 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  45.11 
 
 
590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  46.18 
 
 
630 aa  218  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.96 
 
 
664 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.59 
 
 
761 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  48.36 
 
 
632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  46.48 
 
 
416 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.56 
 
 
618 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  49.41 
 
 
624 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  45.19 
 
 
742 aa  212  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  41.49 
 
 
550 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
564 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0668  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.09 
 
 
464 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
754 aa  211  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  43.4 
 
 
587 aa  210  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  44.4 
 
 
673 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
623 aa  210  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 
620 aa  210  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.43 
 
 
1148 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4116  serine/threonine protein kinase  50.18 
 
 
514 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 
514 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>