95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5428 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  542  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  43.04 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  43.04 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  42.19 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  41.18 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  39.84 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  36.24 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  40.49 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  39.61 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  39.62 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  40.87 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  43.77 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  38.7 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  40.25 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  38.7 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  38.7 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  40.25 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  40.51 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  34.15 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  37.5 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  39.27 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  34.7 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.64 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  39.17 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  40.73 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  37.55 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  38.59 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  37.45 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  36.14 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  35.54 
 
 		 334 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  35.16 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  34.3 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  32.48 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  30.65 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  30.65 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  30.65 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  34.3 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  28.42 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  26.32 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 344 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.46 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.62 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  25 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  25 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  25 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  34.04 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.88 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  33.67 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  34.43 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  33.17 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  33.17 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  33.17 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  33.67 
 
 		 402 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  33.17 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  33.17 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  33.64 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.5 
 
 		 322 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  28.27 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2044  Luciferase-like monooxygenase  28.45 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0320399  normal  0.0772623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  36.94 
 
 		 345 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  27.27 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  31.72 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  36.36 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  33.98 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  34.26 
 
 		 389 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  29.91 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  34.26 
 
 		 389 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  34 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  25.26 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  32.11 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  24.55 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  36.36 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  36.36 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  35.96 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  27.88 
 
 		 353 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  35.23 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  35.23 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  24.22 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  28.47 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  29.27 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.42 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  34.31 
 
 		 386 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  25.27 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  29.25 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  33.33 
 
 		 357 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  34.44 
 
 		 333 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  35.48 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3497  luciferase family oxidoreductase, group 1  32.11 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  24.37 
 
 		 318 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  35.23 
 
 		 346 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>