21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5307 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5307  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  259  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393038  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1159  hypothetical protein  65.55 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1545  protein of unknown function DUF477  46.77 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3518  hypothetical protein  46.09 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11860  protein of unknown function (DUF477)  41.46 
 
 		 171 aa  93.6  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4628  hypothetical protein  49.57 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0203811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3893  hypothetical protein  45.22 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1141  hypothetical protein  45.08 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1827  hypothetical protein  44.88 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000185967  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7337  hypothetical protein  47.01 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0971863  hitchhiker  0.000142423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1599  hypothetical protein  39.2 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7328  hypothetical protein  36.52 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1380  hypothetical protein  35.04 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2575  hypothetical protein  42.7 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3607  hypothetical protein  42.7 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3612  hypothetical protein  42.7 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3680  hypothetical protein  42.7 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4061  hypothetical protein  41.57 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12493  hypothetical protein  41.11 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.226542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00858881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2034  hypothetical protein  31.03 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>