More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5302 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
380 aa  727    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  81.97 
 
 
320 aa  388  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  42.98 
 
 
253 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  41.05 
 
 
256 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  42.61 
 
 
259 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 
256 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 
255 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
238 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 
273 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 
273 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  40.94 
 
 
267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  41.39 
 
 
276 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 
276 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  40.76 
 
 
243 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
262 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
256 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  41.42 
 
 
261 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  33.75 
 
 
325 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  35.48 
 
 
435 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
237 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
239 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
231 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
238 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.8 
 
 
780 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 
237 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
496 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  40.81 
 
 
250 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  36.48 
 
 
416 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
278 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
460 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
241 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
441 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
415 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
266 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
424 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  38.97 
 
 
232 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  35.1 
 
 
428 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
410 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.87 
 
 
257 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
236 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  34.41 
 
 
425 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
613 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  34 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
412 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  34.19 
 
 
574 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
409 aa  99.4  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
285 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
411 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.78 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  28.32 
 
 
238 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 
421 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 
421 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 
421 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
245 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
437 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  33.18 
 
 
883 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.32 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
291 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  34.25 
 
 
261 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
333 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  30.59 
 
 
348 aa  93.2  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
326 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
242 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
242 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  31.84 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34317  dolichol phosphate glucosyltransferase  30.87 
 
 
320 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
250 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
242 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
272 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  38.19 
 
 
410 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
234 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  33.78 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  33.49 
 
 
243 aa  91.3  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.7 
 
 
244 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.03 
 
 
262 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.71 
 
 
255 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
245 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  37.57 
 
 
312 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
234 aa  89.7  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
245 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
230 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
251 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
251 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
229 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1562  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  38.46 
 
 
258 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.41 
 
 
239 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.27 
 
 
255 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
298 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
271 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.19 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
295 aa  87.4  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
237 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>