More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5276 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 656 aa  1254    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  45.14 
 
 		 604 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.42 
 
 		 596 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.53 
 
 		 600 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.57 
 
 		 580 aa  330  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.1 
 
 		 618 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  48.2 
 
 		 427 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  41.27 
 
 		 631 aa  306  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.57 
 
 		 543 aa  298  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  48.52 
 
 		 420 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.18 
 
 		 698 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  38.19 
 
 		 575 aa  276  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  39.09 
 
 		 575 aa  276  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.27 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  40.18 
 
 		 552 aa  273  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.86 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.19 
 
 		 583 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.98 
 
 		 591 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.55 
 
 		 845 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.34 
 
 		 953 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  31.82 
 
 		 520 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.21 
 
 		 589 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  36.48 
 
 		 592 aa  244  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 		 624 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  35.92 
 
 		 966 aa  243  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.62 
 
 		 582 aa  242  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  30.38 
 
 		 992 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  34.4 
 
 		 585 aa  238  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  30.72 
 
 		 1012 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  40.6 
 
 		 542 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  30.05 
 
 		 990 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.86 
 
 		 528 aa  230  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.74 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  36.02 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.28 
 
 		 976 aa  228  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.39 
 
 		 568 aa  226  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.95 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.95 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.38 
 
 		 573 aa  225  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  46.71 
 
 		 498 aa  224  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.22 
 
 		 1018 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  46.02 
 
 		 499 aa  223  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  33.17 
 
 		 971 aa  219  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.99 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  46.38 
 
 		 503 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  36.66 
 
 		 633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  33.65 
 
 		 1003 aa  214  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  29.51 
 
 		 517 aa  214  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.29 
 
 		 552 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1007 aa  213  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  46.05 
 
 		 365 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.72 
 
 		 365 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.41 
 
 		 365 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  37.4 
 
 		 374 aa  208  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  35.8 
 
 		 699 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  42.21 
 
 		 386 aa  208  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  36.3 
 
 		 734 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  43.44 
 
 		 520 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  30.02 
 
 		 997 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.31 
 
 		 426 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.22 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  35.33 
 
 		 699 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  35.57 
 
 		 699 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  41.91 
 
 		 538 aa  204  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.71 
 
 		 395 aa  204  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  29.17 
 
 		 688 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.19 
 
 		 511 aa  201  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  35.78 
 
 		 699 aa  201  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.51 
 
 		 412 aa  200  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.36 
 
 		 1002 aa  200  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  30.66 
 
 		 541 aa  199  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.63 
 
 		 553 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  43.01 
 
 		 538 aa  198  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.06 
 
 		 398 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.97 
 
 		 373 aa  197  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.31 
 
 		 504 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  38.75 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.42 
 
 		 382 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  43.79 
 
 		 365 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.77 
 
 		 484 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  34.52 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.75 
 
 		 392 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.29 
 
 		 375 aa  194  6e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  43.13 
 
 		 490 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 		 594 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.54 
 
 		 543 aa  190  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.78 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.43 
 
 		 490 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  40.61 
 
 		 673 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  37.2 
 
 		 481 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  42.41 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  42.02 
 
 		 544 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.93 
 
 		 482 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  35.28 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  34.53 
 
 		 637 aa  183  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  32.37 
 
 		 557 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.19 
 
 		 375 aa  182  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  33.61 
 
 		 378 aa  181  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.33 
 
 		 478 aa  180  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  41.67 
 
 		 549 aa  180  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>