More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5262 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  63.93 
 
 		 961 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  75.7 
 
 		 1117 aa  732    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  73.86 
 
 		 952 aa  741    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  63.95 
 
 		 987 aa  668    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  70.08 
 
 		 1151 aa  705    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  74.35 
 
 		 1018 aa  703    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  70.26 
 
 		 1080 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  67.13 
 
 		 1016 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  71.48 
 
 		 1265 aa  749    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  75.75 
 
 		 1058 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  73.37 
 
 		 908 aa  728    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  63.95 
 
 		 991 aa  668    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  78.82 
 
 		 1048 aa  739    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  71.73 
 
 		 1244 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  69.41 
 
 		 717 aa  684    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  74.71 
 
 		 1334 aa  794    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  75.15 
 
 		 922 aa  736    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  72.36 
 
 		 1194 aa  949    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  71.23 
 
 		 1043 aa  726    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  74.78 
 
 		 944 aa  723    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  71.21 
 
 		 959 aa  648    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  70.84 
 
 		 1024 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  63.95 
 
 		 991 aa  668    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  65.52 
 
 		 1123 aa  681    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  74.54 
 
 		 1093 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  75.73 
 
 		 990 aa  750    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  75.26 
 
 		 1041 aa  741    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  70.14 
 
 		 1113 aa  709    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  70.42 
 
 		 1091 aa  681    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  100 
 
 		 1427 aa  2742    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  72.35 
 
 		 702 aa  715    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  73.76 
 
 		 974 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  73.31 
 
 		 1007 aa  744    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  75.78 
 
 		 1070 aa  723    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  63.69 
 
 		 953 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  60.51 
 
 		 1022 aa  581  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  52.08 
 
 		 1093 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  51.54 
 
 		 457 aa  412  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  44.63 
 
 		 559 aa  344  9e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  44.12 
 
 		 564 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  43.95 
 
 		 492 aa  337  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  42.66 
 
 		 636 aa  336  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  42.51 
 
 		 562 aa  330  9e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  43.02 
 
 		 543 aa  329  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  41.79 
 
 		 494 aa  327  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  43.97 
 
 		 531 aa  324  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  42.92 
 
 		 503 aa  322  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  42.79 
 
 		 411 aa  320  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  40.14 
 
 		 530 aa  319  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  43.7 
 
 		 483 aa  318  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  43.65 
 
 		 496 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  41.37 
 
 		 503 aa  315  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  39.05 
 
 		 1076 aa  314  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  43.41 
 
 		 496 aa  313  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  40.15 
 
 		 476 aa  313  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  43.51 
 
 		 474 aa  313  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  39.13 
 
 		 1175 aa  310  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  43.41 
 
 		 497 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  42.38 
 
 		 500 aa  308  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  43.89 
 
 		 497 aa  308  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  43.41 
 
 		 497 aa  308  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  40.34 
 
 		 496 aa  308  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  40.34 
 
 		 496 aa  308  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  37.29 
 
 		 926 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  44.58 
 
 		 571 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  39.81 
 
 		 1071 aa  303  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  39.82 
 
 		 517 aa  302  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  38.16 
 
 		 1142 aa  302  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  37.86 
 
 		 1073 aa  301  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  44.89 
 
 		 484 aa  299  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  45.27 
 
 		 485 aa  299  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  37.38 
 
 		 1056 aa  298  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1593  ribonuclease  38.41 
 
 		 1128 aa  297  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  48.61 
 
 		 868 aa  297  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  48.46 
 
 		 860 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  46.15 
 
 		 1031 aa  297  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  45.02 
 
 		 485 aa  296  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  38.94 
 
 		 1057 aa  296  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  39.61 
 
 		 1015 aa  295  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  39.04 
 
 		 496 aa  296  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  47.73 
 
 		 740 aa  296  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02342  RNase E  41.6 
 
 		 1131 aa  295  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.596666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  41.31 
 
 		 489 aa  295  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  48.46 
 
 		 844 aa  294  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  38.26 
 
 		 1084 aa  294  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  38.92 
 
 		 1128 aa  294  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  36.45 
 
 		 1238 aa  294  7e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  37.41 
 
 		 1132 aa  294  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  44.72 
 
 		 416 aa  294  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  41.5 
 
 		 490 aa  294  8e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  40.24 
 
 		 491 aa  294  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  37.27 
 
 		 1141 aa  294  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1756  ribonuclease, Rne/Rng family  37.35 
 
 		 1016 aa  293  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000532878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1874  ribonuclease, Rne/Rng family  39.56 
 
 		 782 aa  293  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000717737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2220  ribonuclease, Rne/Rng family  39.56 
 
 		 782 aa  293  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1242  ribonuclease  37.41 
 
 		 928 aa  293  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  39.86 
 
 		 1035 aa  293  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  39.95 
 
 		 537 aa  293  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  43.89 
 
 		 487 aa  293  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  38.22 
 
 		 1012 aa  293  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>