168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5251 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  35.02 
 
 		 619 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  37.59 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 515 aa  62.4  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.09 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  42.65 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  38.58 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  45.07 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  33.64 
 
 		 525 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 464 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  34.88 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 549 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  33.49 
 
 		 645 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  35.62 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  32.89 
 
 		 510 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.61 
 
 		 601 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  45.45 
 
 		 395 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  31.25 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 514 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  33.61 
 
 		 505 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  31.25 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 377 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  31.76 
 
 		 614 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  26.27 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  26.27 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  34.04 
 
 		 495 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 564 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.27 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  26.27 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  32.5 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  27.27 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  30.23 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  26.27 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 705 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  41.56 
 
 		 505 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 563 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  43.94 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.68 
 
 		 637 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.64 
 
 		 459 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  29.79 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 552 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  39.56 
 
 		 524 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  35.65 
 
 		 616 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 501 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  35.04 
 
 		 517 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  33.99 
 
 		 525 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  45.31 
 
 		 478 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  43.06 
 
 		 543 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  34.97 
 
 		 399 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 403 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  37.36 
 
 		 418 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 408 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  36.78 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.47 
 
 		 480 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  39.45 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  41.98 
 
 		 553 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 405 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  42.62 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  26.27 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  34.38 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  37.36 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  37.27 
 
 		 458 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  50.94 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.77 
 
 		 665 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  38.64 
 
 		 538 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  38.96 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  40.28 
 
 		 514 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  25.42 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 537 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  36.71 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.73 
 
 		 533 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  29.75 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  40.68 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  27.03 
 
 		 741 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4043  putative transcriptional regulator, PucR family  45.56 
 
 		 504 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389127  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  46 
 
 		 554 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 		 520 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  42.19 
 
 		 557 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4011  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  46 
 
 		 554 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  46 
 
 		 554 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  45.1 
 
 		 460 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.83 
 
 		 740 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  33.67 
 
 		 410 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  33.67 
 
 		 410 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  37.11 
 
 		 542 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 542 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1136  transcriptional regulator, CdaR  20.99 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  33.67 
 
 		 410 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.67 
 
 		 410 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 542 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.67 
 
 		 410 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.67 
 
 		 410 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 405 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  29.79 
 
 		 515 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>