More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5248 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 276 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  51.19 
 
 		 227 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  54.07 
 
 		 228 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.62 
 
 		 235 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.08 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.61 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  51.2 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 		 233 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  47.43 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  47.43 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  44 
 
 		 233 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  48.67 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  45.95 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  45.95 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  45.95 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 231 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  45.17 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  45.74 
 
 		 234 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  44.27 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  47.6 
 
 		 234 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  46.12 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 		 241 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  46.56 
 
 		 332 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  39.92 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  46.8 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.08 
 
 		 239 aa  161  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  44.8 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 245 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  32.18 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  32.87 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  34.74 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  29.9 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.58 
 
 		 272 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  33.02 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  27.67 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.534255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.67 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  30.74 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.22 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  32.34 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.2 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.4 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1867  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.5 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0330312  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.85 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.83 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  29.11 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>