More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5232 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  100 
 
 
352 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.7 
 
 
201 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
201 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
215 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2861  methyltransferase type 12  40.54 
 
 
508 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.52 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  43.31 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  40 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.89 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.58 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0023  Methyltransferase type 11  48.54 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.851158 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.64 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.64 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 
237 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  42.06 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.64 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 
241 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 
241 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.88 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.78 
 
 
220 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  42.34 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.88 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.71 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  41.75 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.71 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.94 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  44.55 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1453  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.38 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00782533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  32.98 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.25 
 
 
236 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  41.12 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.54 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.51 
 
 
246 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
195 aa  68.9  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.32 
 
 
272 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  35.19 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  36.53 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.32 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  39.61 
 
 
246 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.88 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  46.49 
 
 
261 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2716  Methyltransferase type 11  40.5 
 
 
221 aa  67  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182754  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
206 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  44.33 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.57 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.22 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.8 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  44.86 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2305  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
624 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  31.48 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  29.2 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  29.2 
 
 
266 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
265 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.14 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 
226 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  41.18 
 
 
239 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.33 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.37 
 
 
271 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  46.46 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  38.93 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
199 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
238 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>